甲型H1N1流感早期症状与普通流感相似，如发热、咳嗽、喉痛、身体疼痛、头痛、发冷和疲劳等，有些还会出现腹泻或呕吐、肌肉痛或疲倦、眼睛发红等症状。少数患者病情来势凶猛、突然高热、体温超过39℃，出现病毒性肺炎，合并呼吸衰竭、多脏器功能损伤，严重者可以导致死亡。